心理咨询师证书是由国家相关部门颁发的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的能力和资格，心理咨询师证书的发放主要由以下几个部门负责：

1、中国心理学会：中国心理学会是全国性的心理学专业组织，负责组织和实施心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过中国心理学会组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师资格证书。

2、各省市心理咨询师协会：各省市心理咨询师协会是地方性的心理学专业组织，负责组织和实施本地区心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过各省市心理咨询师协会组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师资格证书。

3、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是中国政府主管卫生和健康工作的部门，负责制定和实施心理咨询师的职业标准和管理规定，通过国家卫生健康委员会组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师资格证书。

4、国家职业资格认证中心：国家职业资格认证中心是中国政府主管职业资格认证工作的部门，负责组织和实施各类职业资格认证工作，通过国家职业资格认证中心组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师资格证书。

5、国际心理咨询师认证机构：国际心理咨询师认证机构是国际性的心理咨询师认证组织，负责组织和实施国际心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过国际心理咨询师认证机构的心理咨询师资格考试，可以获得国际心理咨询师资格证书。

心理咨询师证书的发放程序主要包括以下几个步骤：

1、报名参加培训：申请人需要先报名参加心理咨询师的培训课程，学习相关的心理学知识和技能，培训课程通常包括心理学基础、心理咨询理论与方法、心理评估与诊断、心理咨询实践等内容。

2、参加考试：培训结束后，申请人需要参加心理咨询师资格考试，考试通常分为笔试和面试两个环节，笔试主要测试申请人的心理学理论知识，面试主要测试申请人的心理咨询技能和实际操作能力。

3、获得资格证书：通过心理咨询师资格考试后，申请人可以向相关部门申请领取心理咨询师资格证书，证书上会注明申请人的姓名、性别、出生日期、身份证号、资格证书编号、发证日期等信息，以及心理咨询师的职业范围和有效期。

4、持证上岗：获得心理咨询师资格证书后，申请人可以在心理咨询机构、医疗机构、学校、企事业单位等场所从事心理咨询工作，在持证期间，申请人需要定期参加继续教育，更新自己的心理学知识和技能，以保持心理咨询师的职业素质。

心理咨询师证书的发放是由国家相关部门负责的，通过参加培训、考试和认证，申请人可以获得心理咨询师资格证书，从而具备从事心理咨询工作的能力和资格。