心理咨询师证书是由国家相关部门颁发的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的资格和能力，心理咨询师证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会是全国性的专业学术团体，成立于1983年，隶属于国家卫生健康委员会，该协会的主要职责是组织、协调、指导和推动全国心理卫生工作的发展，为政府决策提供专业建议，为广大心理卫生工作者提供服务，中国心理卫生协会负责组织心理咨询师资格考试，对考试合格的人员颁发心理咨询师证书。

2、中国心理学会：中国心理学会成立于1921年，是全国性的心理学专业学术团体，隶属于国家教育部，中国心理学会的主要职责是组织、协调、指导和推动全国心理学研究和应用的发展，为政府决策提供专业建议，为广大心理学工作者提供服务，中国心理学会负责组织心理咨询师资格考试，对考试合格的人员颁发心理咨询师证书。

3、各省市心理卫生协会：各省市心理卫生协会是地方性的心理卫生专业学术团体，隶属于各省市卫生健康委员会，各省市心理卫生协会的主要职责是组织、协调、指导和推动本地区心理卫生工作的发展，为政府决策提供专业建议，为广大心理卫生工作者提供服务，各省市心理卫生协会负责组织心理咨询师资格考试，对考试合格的人员颁发心理咨询师证书。

心理咨询师证书的颁发程序如下：

1、报名参加心理咨询师资格考试：符合报考条件的人员，需在规定的时间内向所在地的心理卫生协会或心理学会报名，填写报名表并提交相关材料。

2、参加培训：报名成功的人员需参加由心理卫生协会或心理学会组织的心理咨询师培训课程，学习心理咨询的基本理论、技能和方法。

3、参加考试：培训结束后，学员需参加由心理卫生协会或心理学会组织的心理咨询师资格考试，考试分为笔试和面试两部分，笔试主要测试学员的理论知识，面试主要测试学员的实践能力和沟通能力。

4、领取证书：考试合格后，学员需向心理卫生协会或心理学会提交相关材料，办理心理咨询师证书的领取手续。

心理咨询师证书的有效期为5年，有效期满后，持证人需参加继续教育，学习新的心理咨询理论、技能和方法，并通过继续教育考核，方可延长证书的有效期。

心理咨询师证书的颁发主要由国家相关部门负责，如中国心理卫生协会、中国心理学会和各省市心理卫生协会等，考生需按照相关程序报名参加考试、参加培训、参加考试，考试合格后领取心理咨询师证书，持有心理咨询师证书的人员，需不断学习和提高自己的心理咨询能力，为社会提供专业的心理咨询服务。