心理咨询师证书与机构的关系是一个复杂的问题，涉及到培训、认证和实践等多个方面，在回答这个问题之前，我们首先需要了解心理咨询师证书的含义和作用。

心理咨询师证书是一种专业资格证书，证明持有人具备从事心理咨询工作的能力和素质，心理咨询师证书分为三级：初级、中级和高级，要获得这些证书，申请人需要参加相应的培训课程，并通过国家认可的考试，这些课程通常由专业的培训机构提供，如大学、职业学校等。

心理咨询师证书是否一定要跟机构有关呢？答案是：不一定，从培训的角度来看，申请人可以选择自学或者参加培训机构的课程，自学的难度较大，需要申请人具备较强的自律性和学习能力，自学可能无法获得系统的知识和技能，影响考试成绩，大多数人还是选择参加培训机构的课程。

从认证的角度来看，心理咨询师证书的颁发是由国家相关部门负责的，与培训机构没有直接关系，只要申请人通过了考试，就可以获得相应的证书，培训机构可以为申请人提供更加专业和系统的培训服务，提高通过考试的概率，一些培训机构还与用人单位建立了合作关系，为学员提供实习和就业机会。

从实践的角度来看，心理咨询师证书只是进入这个行业的一个门槛，要想成为一名优秀的心理咨询师，还需要不断地学习和实践，在这个过程中，培训机构可以提供一定的支持和帮助，如组织实践活动、提供案例分析等，这并不意味着申请人必须依赖培训机构，许多成功的心理咨询师并没有参加过任何培训课程，而是通过自学和实践经验积累成长起来的。