心理咨询师证书发放机构是负责对心理咨询师进行资格认证和培训的部门，这个部门主要由国家卫生健康委员会（简称国家卫健委）和人力资源和社会保障部（简称人社部）共同负责，这两个部门分别从医疗卫生和人力资源管理的角度，对心理咨询师的培养、选拔、管理和监督进行指导和规范。

国家卫健委主要负责心理咨询师的医疗属性方面的管理，根据《中华人民共和国卫生法》和《中华人民共和国执业医师法》，国家卫健委对心理咨询师的执业资格、执业范围、执业行为等方面进行监管，国家卫健委还制定了一系列关于心理咨询师的培训、考核、评价等方面的政策和规定，以确保心理咨询师具备一定的医学知识和技能，能够为患者提供专业、安全、有效的心理咨询服务。

人社部则主要负责心理咨询师的人力资源管理方面的管理，根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国职业培训法》，人社部对心理咨询师的职业培训、职业资格、职业发展等方面进行监管，人社部还制定了一系列关于心理咨询师的招聘、培训、考核、晋升等方面的政策和规定，以确保心理咨询师具备一定的职业技能和素质，能够为社会提供高质量的心理咨询服务。

在实际操作中，心理咨询师证书发放机构主要包括以下几个方面：

1、培训机构：心理咨询师需要接受专业的培训，以提高自己的心理学知识和技能，培训机构通常由国家卫健委和人社部认可的专业机构承担，如各大高校、科研院所、心理咨询中心等，这些培训机构需要按照国家卫健委和人社部的要求，制定培训计划、教材、教学方法等，确保培训质量。

2、考核机构：心理咨询师需要通过国家卫健委和人社部组织的考试，以获得心理咨询师资格证书，考核机构通常由国家卫健委和人社部认可的专业机构承担，如各大高校、科研院所、心理咨询中心等，这些考核机构需要按照国家卫健委和人社部的要求，组织考试、评卷、发证等工作，确保考核的公平、公正、公开。

3、注册机构：心理咨询师需要向国家卫健委和人社部注册，以获得执业资格，注册机构通常由国家卫健委和人社部指定的专业机构承担，如各地卫生健康委员会、人力资源和社会保障局等，这些注册机构需要按照国家卫健委和人社部的要求，审核申请人的资格、资料、培训记录等，确保注册的合规、有效。

4、监管部门：心理咨询师需要接受国家卫健委和人社部的监管，以确保其执业行为的合规、安全、有效，监管部门通常由国家卫健委和人社部指定的专业机构承担，如各地卫生健康委员会、人力资源和社会保障局等，这些监管部门需要按照国家卫健委和人社部的要求，对心理咨询师的执业行为、培训记录、考核成绩等进行定期检查、评估、指导，确保心理咨询师的服务质量和行业发展。

心理咨询师证书发放机构是一个涉及多个部门、多个环节的管理体系，国家卫健委和人社部作为主管部门，通过制定政策、规定、标准等，对心理咨询师的培养、选拔、管理和监督进行指导和规范，以确保心理咨询师具备一定的医学知识和技能，能够为患者提供专业、安全、有效的心理咨询服务。