心理咨询师证书是由国家相关部门颁发的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的资格和能力，心理咨询师证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、国家卫生健康委员会（National Health Commission，简称NHC）：作为中国卫生行业的主管部门，国家卫生健康委员会负责制定和实施心理咨询师的职业标准和培训要求，国家卫生健康委员会还会对心理咨询师的培训和考试进行监督和管理，确保心理咨询师的专业素质和服务质量。

2、人力资源和社会保障部（Ministry of Human Resources and Social Security，简称MHRSS）：人力资源和社会保障部负责制定和实施心理咨询师的职业资格认证制度，对心理咨询师的培训、考试和颁发证书进行统一管理，人力资源和社会保障部还会对心理咨询师的职业发展、职称评定等方面提供指导和支持。

3、中国心理卫生协会（China Association for Mental Health，简称CAMH）：中国心理卫生协会是全国性的心理卫生专业组织，负责推动心理卫生事业的发展，提高心理咨询师的专业水平，中国心理卫生协会会定期组织心理咨询师的培训和考试，对通过考试的心理咨询师颁发证书。

4、地方卫生健康行政部门：各省、自治区、直辖市的卫生健康行政部门负责在本行政区域内组织实施心理咨询师的培训、考试和证书颁发工作，地方卫生健康行政部门会与国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部等部门密切合作，确保心理咨询师证书的权威性和有效性。

心理咨询师证书的颁发程序如下：

1、报名参加培训：心理咨询师证书的申请者需要先报名参加由国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、中国心理卫生协会或地方卫生健康行政部门组织的心理咨询师培训课程。

2、参加培训：申请者需要按照培训机构的要求，参加为期一定时间的理论学习和实践操作培训，培训内容通常包括心理学基础知识、心理咨询技巧、心理评估方法等。

3、参加考试：培训结束后，申请者需要参加由国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、中国心理卫生协会或地方卫生健康行政部门组织的心理咨询师考试，考试通常分为理论考试和实践操作考试两部分，以检验申请者是否具备从事心理咨询工作的基本能力和素质。

4、领取证书：通过考试的申请者可以向培训机构或地方卫生健康行政部门申请领取心理咨询师证书，证书上会注明申请人的姓名、性别、出生日期、身份证号、职业资格证书编号等信息，以及发证部门和发证日期。

5、注册执业：拿到心理咨询师证书后，申请者还需要在国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、中国心理卫生协会或地方卫生健康行政部门指定的机构进行注册，方可正式从事心理咨询工作。

心理咨询师证书的颁发是由国家相关部门负责的，旨在确保心理咨询师具备从事心理咨询工作的资格和能力，为广大求助者提供优质的心理咨询服务。