心理咨询师证书的发放机构主要是由政府相关部门和专业认证机构负责，这些机构通过严格的考试和评估，确保持有心理咨询师证书的人员具备专业的心理咨询知识和技能，能够为求助者提供有效的心理咨询服务，以下是一些主要的心理咨询师证书发放机构：

1、国家卫生健康委员会（National Health Commission）：作为中国政府的主要卫生管理部门，国家卫生健康委员会负责制定和实施心理健康相关的政策、法规和标准，该委员会也负责对心理咨询师进行资格认定和证书发放。

2、中国心理学会（Chinese Psychological Society）：中国心理学会是一个全国性的专业学术组织，旨在推动心理学的发展和应用，该学会负责组织心理咨询师的培训、考试和认证工作，并向合格的心理咨询师颁发证书。

3、中国心理卫生协会（China Association for Mental Health）：中国心理卫生协会是一个专门从事心理卫生工作的社会组织，致力于提高公众的心理健康水平，该协会负责组织心理咨询师的培训、考试和认证工作，并向合格的心理咨询师颁发证书。

4、各省市卫生健康委员会：在国家卫生健康委员会的指导下，各省市卫生健康委员会负责本地区心理咨询师的资格认定和证书发放工作，这些机构通常会与当地的心理学会和心理卫生协会合作，共同开展心理咨询师的培训、考试和认证工作。

5、专业认证机构：除了政府相关部门外，还有一些专业的认证机构负责心理咨询师证书的发放，这些认证机构通常具有较高的权威性和专业性，其认证的心理咨询师证书在业界具有较高的认可度，美国心理咨询协会（American Counseling Association）和中国心理咨询师协会（China Association of Professional Counselors）等。

心理咨询师证书的发放机构主要包括国家卫生健康委员会、中国心理学会、中国心理卫生协会、各省市卫生健康委员会以及专业认证机构等，这些机构通过严格的考试和评估，确保持有心理咨询师证书的人员具备专业的心理咨询知识和技能，为求助者提供有效的心理咨询服务。