国家卫健委心理咨询师证和中科院心理咨询师证都是国内比较认可的心理健康相关证书，但它们之间还是存在一定的差异，在选择考取哪种证书时，我们需要从以下几个方面进行综合考虑：

1、发证机构权威性

国家卫健委心理咨询师证是由国家卫生健康委员会颁发的，具有很高的权威性，国家卫生健康委员会是国务院组成部门，负责全国卫生健康工作的领导和管理，国家卫健委心理咨询师证在业界的认可度较高，对于从事心理咨询工作的人员来说，具备这个证书可以增加自己的竞争力。

中科院心理咨询师证是由中国科学院心理研究所颁发的，中国科学院心理研究所是国内心理学研究的重要基地，具有较高的学术地位，中科院心理咨询师证在学术界的认可度较高，对于从事心理学研究和教学工作的人员来说，具备这个证书可以增加自己的专业素养。

2、考试内容和难度

国家卫健委心理咨询师证的考试内容主要包括心理学基础知识、心理咨询技能和实践操作等方面，考试形式为笔试和实操，笔试主要测试考生的理论知识掌握程度，实操主要测试考生的实际操作能力，国家卫健委心理咨询师证的考试难度适中，只要认真备考，通过考试的概率较大。

中科院心理咨询师证的考试内容主要包括心理学基础知识、心理咨询技能和实践操作等方面，考试形式为笔试和实操，笔试主要测试考生的理论知识掌握程度，实操主要测试考生的实际操作能力，中科院心理咨询师证的考试难度较高，需要考生具备较强的理论基础和实践能力。

3、适用范围

国家卫健委心理咨询师证适用于从事心理咨询、心理治疗、心理评估等相关工作的人员，持有该证书的人员可以在医疗机构、心理咨询机构、企事业单位等从事心理健康服务工作。

中科院心理咨询师证适用于从事心理学研究、教学、心理咨询等工作的人员，持有该证书的人员可以在高校、科研院所、心理咨询机构等从事心理学相关工作。

4、培训和指导

国家卫健委心理咨询师证的培训和指导主要由国家卫生健康委员会指定的培训机构进行，培训内容和质量有保障，国家卫生健康委员会还会定期组织心理咨询师的继续教育，帮助持证人员不断提高自己的业务水平。

中科院心理咨询师证的培训和指导主要由中国科学院心理研究所进行，培训内容和质量有保障，中科院心理研究所还会定期组织心理咨询师的学术交流和研讨活动，帮助持证人员不断提高自己的学术素养。

国家卫健委心理咨询师证和中科院心理咨询师证各有优缺点，具体选择哪种证书需要根据个人的职业发展需求和兴趣进行综合考虑，如果主要从事心理健康服务工作，建议考取国家卫健委心理咨询师证；如果主要从事心理学研究和教学工作，建议考取中科院心理咨询师证，如果条件允许，两个证书都考取也是很好的选择，这样可以更全面地提高自己的专业素养和竞争力。