心理咨询师证书是由国家相关部门核发的，主要是由国家卫生健康委员会（原卫生部）和国家人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部）共同负责，这两个部门分别负责心理咨询师的培训、考核和认证工作，以确保心理咨询师的专业素质和服务水平。

国家卫生健康委员会是中国政府主管卫生和健康工作的部门，其主要职责包括制定卫生健康政策、法规和标准，组织实施卫生健康规划，监督管理医疗卫生服务，以及开展健康教育和健康促进工作等，在心理咨询领域，国家卫生健康委员会主要负责制定心理咨询师的职业标准和培训大纲，以及对心理咨询师的培训和考核工作进行指导和监督。

为了提高心理咨询师的专业素质和服务水平，国家卫生健康委员会制定了《心理咨询师职业资格标准》和《心理咨询师培训大纲》，明确了心理咨询师的基本要求、培训内容和考核标准，国家卫生健康委员会还设立了专门的心理咨询师培训基地，负责组织和管理心理咨询师的培训工作。

国家人力资源和社会保障部是中国政府主管人力资源和社会保障工作的部门，其主要职责包括制定人力资源和社会保障政策、法规和标准，组织实施人力资源和社会保障规划，监督管理人力资源和社会保障服务，以及开展人力资源和社会保障教育和培训工作等，在心理咨询领域，国家人力资源和社会保障部主要负责对心理咨询师的考核和认证工作进行指导和监督。

为了确保心理咨询师的专业素质和服务水平，国家人力资源和社会保障部制定了《心理咨询师职业资格考试办法》，明确了心理咨询师的考试科目、考试形式和考试时间等，国家人力资源和社会保障部还设立了专门的心理咨询师认证中心，负责组织和管理心理咨询师的认证工作。

在心理咨询师的培训、考核和认证过程中，国家卫生健康委员会和国家人力资源和社会保障部密切合作，共同确保心理咨询师的专业素质和服务水平，国家卫生健康委员会负责制定心理咨询师的培训大纲和职业标准，为心理咨询师的培训和考核提供依据，国家人力资源和社会保障部根据国家卫生健康委员会制定的培训大纲和职业标准，组织心理咨询师的职业资格考试，对通过考试的心理咨询师颁发职业资格证书。

心理咨询师证书是由国家卫生健康委员会和国家人力资源和社会保障部共同核发的，这两个部门分别负责心理咨询师的培训、考核和认证工作，以确保心理咨询师的专业素质和服务水平，通过国家卫生健康委员会和国家人力资源和社会保障部的共同努力，我国心理咨询师队伍的专业素质和服务水平得到了不断提高，为广大人民群众提供了更加专业、高效的心理咨询服务。