心理咨询师证书的发放机构主要包括国家卫生健康委员会、国家人力资源和社会保障部、中国心理学会等单位，这些单位负责审核心理咨询师的资质和能力，确保他们具备从事心理咨询工作的专业知识和技能。

1、国家卫生健康委员会

国家卫生健康委员会（National Health Commission，简称NHC）是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责全国卫生健康工作的领导和管理，在心理咨询领域，国家卫生健康委员会主要负责制定相关政策和法规，对心理咨询师的培训、考核、认证等工作进行指导和监督。

2、国家人力资源和社会保障部

国家人力资源和社会保障部（Ministry of Human Resources and Social Security，简称MOHRSS）是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责全国人力资源和社会保障工作的领导和管理，在心理咨询领域，国家人力资源和社会保障部主要负责心理咨询师的职业资格认定、职业培训、职业发展等方面的工作。

3、中国心理学会

中国心理学会（Chinese Psychological Society，简称CPS）是全国性的学术性、非营利性的社会团体，主要由心理学工作者和心理学爱好者组成，中国心理学会的主要职责是推动心理学的发展，提高心理学工作者的专业素质，为政府和社会提供心理学方面的专业服务，在心理咨询领域，中国心理学会主要负责组织心理咨询师的培训、考核、认证等工作，以及开展心理咨询师的职业发展和服务推广。

4、地方卫生健康部门

除了国家级的发放机构外，各省级、市级卫生健康部门也承担着心理咨询师证书发放的审核工作，这些部门主要负责本地区心理咨询师的培训、考核、认证等工作，以及对心理咨询服务机构的管理和监督。

5、专业培训机构

除了政府部门外，还有一些专业的心理咨询师培训机构，如心理咨询师培训学校、心理咨询师培训班等，这些培训机构主要负责为学员提供心理咨询师的培训课程，帮助他们掌握心理咨询的专业知识和技能，在培训过程中，这些培训机构会对学员进行考核，确保他们具备从事心理咨询工作的基本能力，通过考核的学员，可以向相关发放机构申请心理咨询师证书。

6、国际心理咨询师认证机构

随着国际交流的不断加深，一些国际心理咨询师认证机构也开始在中国开展业务，为中国的心理咨询师提供国际认证服务，这些认证机构通常需要与中国政府相关部门合作，共同制定认证标准和程序，确保认证的权威性和专业性。

心理咨询师证书的发放机构主要包括国家卫生健康委员会、国家人力资源和社会保障部、中国心理学会等单位，这些单位负责审核心理咨询师的资质和能力，确保他们具备从事心理咨询工作的专业知识和技能，地方卫生健康部门、专业培训机构和国际心理咨询师认证机构也在一定程度上参与了心理咨询师证书发放的审核工作。