胚胎发育不良的原因主要分为以下四个方面：第一、胚胎染色体异常。第二、母体因素，例如黄体功能不全、多囊卵巢、高泌乳素血症、甲状腺功能减退、妊娠早期糖尿病、生殖器官发育畸形、母体免疫异常。第三、父亲因素，主要是精子染色体异常。第四、环境因素，包括接触过多的放射线或者有毒有害的化学物质。