试管婴儿和自然怀孕的不同之处在于试管婴儿是将男性的精子和女性的卵子取出体外以后，通过人为的特殊方式形成受精卵，再次放入到女性宫腔内，胚胎不是通过性行为形成的。自然怀孕是男性的精液通过性生活直接射入到女性阴道内，精子和卵子通过自然结合形成胚胎。