新生儿长眼屎是发生了新生儿结膜炎。引起新生儿结膜炎有淋球菌感染，还有是衣原体或者是支原体感染所引起，因此要及时去医院就诊，在医生检查诊断下给予相应治疗。有眼屎是由于新生儿内囊炎，还有泪道不通所导致，因此也要去医院进行观察。