巧克力囊肿因为会影响卵巢正常排卵，并且有可能影响盆腔粘连，影响输卵管扭曲堵塞，会影响怀孕。所以有巧克力囊肿的女性如果直径比较大，超过三厘米以上，可以考虑先手术治疗，这样可以减少包块的形成；可以促进卵巢正常排卵，可以增加受孕的几率。