房颤手术有可能会留后遗症的。而房颤手术的主要后遗症有穿刺点出血、血肿、动静脉瘘以及患者心律失常，仍然顽固不能够治愈，甚至出现患者的肢体瘫痪以及脑梗塞的后遗症。所以在房颤手术后，一定要持续观察患者的生命体征，保证安全的前提下，做好定期复查，根据复查结果及时调整治疗方案。