桥本甲状腺炎是不能根治的，是一种自身免疫性疾病，目前没有任何一种药物能够治愈桥本甲状腺炎，中和体内升高的抗体。甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体会终身存在，都会终身破坏患者的甲状腺组织，大多数患者会出现甲状腺功能减退症状，需服用甲状腺激素进行补充替代疗法，也有部分患者甲状腺功能终身处于正常状态。