肾结石碎石常见的副作用如下：一、在手术的时候使用输尿管镜有可能伤到输尿管、膀胱或者肾脏，导致管腔破裂。二、经皮肾镜碎石术在手术的时候可能引起大出血，因为肾脏里面血供十分丰富，如果伤到比较大的血管会导致出血不止。三、手术后由于输尿管受到损伤，可能导致输尿管狭窄。