乳糖不耐受能否自愈，需要根据具体类型来判断。乳糖不耐受根据发病原因不同，可以分为先天性乳糖酶缺乏、原发性乳糖酶缺乏症及继发性乳糖酶缺乏症。其中，先天性和原发性乳糖酶缺乏症，临床上难以彻底治愈，需要长期注意调整饮食。继发性乳糖酶缺乏症，经过一段时间恢复后可能会自愈。