支气管镜检查取活检有可能会损伤到支气管，因为这是一种镜下的操作，也是属于一种有创性的操作，任何操作都存在一定的风险，医生也不能保证100%的安全。取活检也可能会存在有大出血或者窒息的风险，所以在做支气管镜时需要患者能够耐受，并且能够配合医生的治疗，只有这样才会使风险降到最低。