虫子飞进眼睛里，需要通过以下方式治疗：第一、要立即用清水冲洗眼睛，将结膜囊中虫子的尸体冲洗出来。第二、要注意不能揉搓眼睛，以免导致角膜组织出现划伤，甚至角膜上皮剥脱。第三、可以点抗生素滴眼液，预防眼部发生感染，例如常用的有左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、莫西沙星滴眼液等。