引起肚子隐隐作痛的原因有很多，可能和以下几方面有关：一，饮食不洁、食源性污染等因素，导致肠胃炎、慢性肠炎症状。二，胆囊炎、胆囊结石受饮食方面影响以及长期累积而发病，早期会出现肚子隐隐作痛的表现。三，经常暴饮暴食或者辛辣食物摄入过多会产生肠道息肉，导致肠道病变从而出现隐痛。四，若是女性患有盆腔炎、附件炎等，均会伴随隐痛症状。五，其他方面，包括慢性阑尾炎、泌尿系统结石、泌尿系统感染也会出现隐痛。