大部分情况下，怀孕40天B超是能够看到孕囊的；但是有些特殊情况，B超无法看到孕囊。一、对于月经不规则的女性，可能存在排卵期的延迟以及受精卵形成时间比较长，40天B超可能看不到孕囊。二、对于胚胎发育不好，有可能出现胎停的现象时，B超也可能看不到明显的孕囊，三、有可能是宫外孕的情况，在B超下无法显示宫腔内有孕囊的出现。因此，怀孕40天B超如果没有看到孕囊先不要担心，抽血测HCG进行动态的监测，并且结合动态的超声检查进行综合评判。