孩子在大便的时候肛门疼痛，考虑原因可能是跟孩子便秘有关。便秘的情况下，孩子排便比较费力，所以会把肛门造成损伤，会有疼痛的感觉。另外一方面，孩子若是肠道感染了病原体，例如感染了痢疾杆菌，也有可能在排大便的时候出现肛门疼痛。因此，若是孩子大便时具有肛门疼痛，要注意分辨大便的性质。