眼睛进东西磨疼，需要通过以下方式治疗：第一、注意不能揉搓眼部，以免导致眼内的异物划伤角膜上皮。第二、可以使用清水或洗眼液冲洗结膜囊，争取将进入眼睛结膜囊的异物冲洗出来。第三、可以在眼部点促进角膜修复的药物治疗，如重组人表皮生长因子滴眼液等。第四、可以通过做裂隙灯显微镜检查等发现异物并将其取出。