飞秒手术和半飞秒手术的区别在于以下几点：第一，它们用的仪器设备不完全一样，半飞秒手术用到两台设备，一台是飞秒设备，一台是准分子激光设备。而全飞秒手术用到的是全程的飞秒激光设备。第二，手术的程序不一样，半飞秒激光先利用飞秒激光设备做角膜瓣，再用准分子激光设备完成后续的角膜切削过程，而全飞秒的手术是全程使用飞秒激光，不需要做角膜瓣，主要在角膜上切一个小切口，做角膜内的透镜，把透镜取出来以后，这个手术就完成了。