头疼流眼泪的原因有很多，主要包括以下几种：第一、外界花粉、尘螨等过敏性物质导致机体过敏，出现打喷嚏、咳嗽、流眼泪等，同时剧烈的打喷嚏、咳嗽，会使人发生头痛。第二、各种因素导致剧烈头痛，疼痛难以忍受，而发生流眼泪、如牙痛、手术、颅脑外伤、脑肿瘤、脑炎等。如果因剧烈外伤出现头痛，不要轻易移动身体，可以由他人帮助拨打120，由专业的医护人员处理。如果在日常生活中出现剧烈的头痛，需要及时到医院诊疗，排除严重的疾病。