如果是孕期孕酮值低，主要有两方面的原因，首先是由于内分泌疾病所致，例如黄体功能不全、多囊卵巢、高泌乳素血症以及甲状腺功能减退等。其次是由于妊娠组织发育不良所致，容易引起流产。如果是非孕期孕酮值低，通常与排卵有一定的关系，属于正常现象。