两个肩膀头酸痛的原因主要有以下几个方面：第一、可能是肩膀受寒凉导致。第二、可能是类风湿性关节炎或风湿性关节炎导致。第三、可能是颈间盘突出压迫神经导致。第四、可能是剧烈运动，如打羽毛球或游泳后出现的肌肉酸痛。建议患者多休息，适当对患处进行热敷，症状严重的需要及时就医检查治疗。