扁桃体发炎发烧不退要针对病因进行治疗，扁桃体发炎发烧不退主要是因为体内的病原体没有被完全清除所导致，扁桃体发炎主要是葡萄球菌或者是溶血性链球菌感染为主。所以在临床上要选用针对以上两种细菌比较敏感的药物来进行治疗，可以选择青霉素类或者一代头孢、二代头孢予以抗感染治疗，疗程一般为五到七天，一般在经过积极的抗感染治疗之后发烧症状会逐渐得到缓解。