上小便时候尿道刺痛可能为膀胱炎、尿道炎、尿道结石等疾病所引起，需要进行尿常规、尿培养、泌尿系彩超等检查确诊。如果存在分泌物，还应当做分泌物常规和分泌物培养检查；如果存在感染，应当使用抗生素药物进行治疗；如果有尿道结石，应当根据结石大小以及位置，进行药物排石体外冲击波碎石或手术去石。