如果产后三个月小腹疼痛，需要考虑生殖器官是否存在病变，比如炎症、肿瘤、囊肿等。同时，需要排除阑尾炎、胃肠炎等疾病所造成的疼痛。如果产后三个月小腹疼痛，一般不考虑是因为分娩的因素所致，因为此时子宫已经恢复到非孕期大小，宫口也已经闭合。