羊水穿刺和无创DNA两者相比，羊水穿刺的准确率更高。但是由于羊水穿刺属于有创伤性的检查，因此在临床上并不是每个孕妇都需要行这项检查。因为容易导致流产，甚至胎死宫内等风险的情况发生。所以一般孕妇在对于胎儿进行疾病筛查的时候，首先是做无创DNA的筛查，这项检查是没有创伤性的。如果结果显示异常，必要的情况下需要行羊水穿刺进行进一步的确诊，因此两者是有区别的。